Game ninja có tổng số 40 kĩ năng khác nhau mà bạn có thể lựa chọn cho nhân vật của mình.
Các bạn có thể tham khảo 1 số cách build skill chính tại:
Click here Một số cách build skill
Click here 3 hướng build cơ bản
Click here Tham khảo các skill ninja
Xin phép được tóm tắt về một vài đường build skill thông dụng:
1. ATTACKER – Tấn công
Đường build này tập trung vào việc nâng cao sức sát thương của nhân vật, với các chỉ số chủ đạo là : Tấn công, Phá giáp, Bạo kích.
Attacker 1: Crystal Blade
Một hướng build kĩ năng đang được ưa chuộng hiên nay và khá hiệu quả trong thi đấu:
Kỹ năng sử dụng:
+ skill gây sát thương mạnh 
.
Attacker 2: Hỏa thuật
Tuy nhiên hiện không nhiều bạn dám can đảm chọn con đường này, vì đầu game đây không phải cách build hiệu quả.
Kỹ năng hệ hỏa 
+ 
hoặc kỹ năng hỗ trợ sinh tồn 
2. SPEEDER - Tốc độ
Đây là đường build tập trung chủ yếu vào tốc độ tấn công, được nhiều bạn mới chơi ưa thích, vì phong cách đánh áp đảo rất đẹp mắt.
Có thể nói đến một số cách build speed điển hình như:
Speeder 1: Thuần speed
.
.
Cách đánh này về cơ bạn là tận dụng tốc độ và các hiệu ứng làm chậm đối phương, tạo ra thế đánh áp đảo liên tiếp, gây lượng sát thương lớn trong khi kích hoạt bom nổ chậm , kết thúc đồi phương sau 1 sê ri đòn liên tiếp. Nhược điểm bộ skill này là có khá nhiều cách khắc chế như
Speeder 2: Speed Dmg
Speed dmg cũng là 1 cách build khá phổ biến, và có phần hiệu quả hơn cách build trên, sử dụng cách build sau
ới 1 lượng lớn các skill có thể vô hiệu hóa đối phương, cướp lượt, cách build skill này đang được không ít cao thủ sử dụng khi đánh đấu trường cũng như cúp thế giới.
3. TANKER - Phòng thủ
Chỉ số chủ đạo cho tanker là máu, phòng thủ. Ngoài ra né tránh hay đỡ đòn giúp giảm sát thương cũng không phải lựa chọn tồi. Cách đánh tanker được chia ra làm 2 đường chính:
Tanker 1: Rebounder: tank và phản dmg
Ngoài các skill tank thông dụng như 
, các ninja sử dụng 
hay 
để tiêu diệt đối thủ dần dần.
Một biến thể của tank – rebound xoay quanh combo , cũng có thể gây ra lượng dmg rất lớn về phía đối thủ.
Tanker 2: Chakra eater: đốt MP đối phương
Đây là hướng build làm nên tên tuổi của Kurotsuchi Nemu – với lượng máu cực lớn và khả năng loại bỏ hoàn toàn lượng chakra của đối phương chỉ sau 1, 2 nhát dao chakra 
.
Với combo phá chakra gồm 
, kết hợp với các skill tank khác như hay sử dụng , các tanker theo đường này luôn là nỗi ác mộng cho mọi đối thủ.
Ngoài ra ta cũng có thể bắt gặp các ninja theo speed và tank chơi chakra eater rất hiệu quả, tiêu biểu như Toushiro, Haku